データフレームのテキストファイル出力

データフレームxを行名，列名なし，タブ区切りでファイル出力をするなら，

write.table(x,"hoge.dat",sep="\t",col.names=FALSE,row.names=FALSE)

できる場所はカレントディレクトリです．changedirでディレクトリの場所をあらかじめ指定しておきます．それが嫌ならば，ファイル名はフルパスで書きましょう．